CRAN Package Check Results for Package popkin

Last updated on 2022-08-15 08:50:04 CEST.

Flavor	Version	T_install	T_check	T_total	Status
r-devel-linux-x86_64-debian-clang	1.3.17	32.52	49.25	81.77	NOTE
r-devel-linux-x86_64-debian-gcc	1.3.17	23.22	38.08	61.30	NOTE
r-devel-linux-x86_64-fedora-clang	1.3.17			110.90	NOTE
r-devel-linux-x86_64-fedora-gcc	1.3.17			106.56	NOTE
r-devel-windows-x86_64	1.3.17	34.00	100.00	134.00	ERROR
r-patched-linux-x86_64	1.3.17	23.82	50.01	73.83	OK
r-release-linux-x86_64	1.3.17	26.69	49.05	75.74	OK
r-release-macos-arm64	1.3.17			31.00	NOTE
r-release-macos-x86_64	1.3.17			41.00	NOTE
r-release-windows-x86_64	1.3.17	29.00	104.00	133.00	ERROR
r-oldrel-macos-arm64	1.3.17			31.00	OK
r-oldrel-macos-x86_64	1.3.17			40.00	NOTE
r-oldrel-windows-ix86+x86_64	1.3.17	68.00	134.00	202.00	OK

Check Details

Version: 1.3.17
Check: package dependencies
Result: NOTE
Package suggested but not available for checking: 'lfa'
Flavors: r-devel-linux-x86_64-debian-clang, r-devel-linux-x86_64-debian-gcc, r-devel-linux-x86_64-fedora-clang, r-devel-linux-x86_64-fedora-gcc, r-release-macos-arm64, r-release-macos-x86_64, r-oldrel-macos-x86_64

Version: 1.3.17
Check: tests
Result: ERROR
     Running 'testthat.R' [11s]
    Running the tests in 'tests/testthat.R' failed.
    Complete output:
     > library(testthat)
     > library(popkin)
     >
     > test_check('popkin')
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
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     OS - Alias wurde nicht gefunden.
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     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
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     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     [ FAIL 14 | WARN 26 | SKIP 0 | PASS 539 ]

     ══ Failed tests ════════════════════════════════════════════════════════════════
     ── Failure (test_popkin.R:250:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(X)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:255:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(X + 0)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:260:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(2L - X)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:265:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(2 - X)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:271:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(X, m_chunk_max = 1)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:413:5): function returns precomputed values: popkin ──
     `obj <- popkin(X, want_M = TRUE)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:417:5): function returns precomputed values: popkin ──
     `obj <- popkin(X, subpops, want_M = TRUE)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:956:5): popkin_af works ──────────────────────────────
     `coancestry2 <- popkin_af(P)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:961:5): popkin_af works ──────────────────────────────
     `obj <- popkin_af(P, want_M = TRUE)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:968:5): popkin_af works ──────────────────────────────
     `coancestry2 <- popkin_af(P_miss)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:973:5): popkin_af works ──────────────────────────────
     `obj <- popkin_af(P_miss, want_M = TRUE)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:980:5): popkin_af works ──────────────────────────────
     `obj2 <- popkin_af(t(P_miss), want_M = TRUE, loci_on_cols = TRUE)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin_BEDMatrix.R:17:9): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(X)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin_fn.R:34:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(Xf, n = n)` produced warnings.

     [ FAIL 14 | WARN 26 | SKIP 0 | PASS 539 ]
     Error: Test failures
     Execution halted
Flavor: r-devel-windows-x86_64

Version: 1.3.17
Check: tests
Result: ERROR
     Running 'testthat.R' [10s]
    Running the tests in 'tests/testthat.R' failed.
    Complete output:
     > library(testthat)
     > library(popkin)
     >
     > test_check('popkin')
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
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     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
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     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     [ FAIL 14 | WARN 26 | SKIP 0 | PASS 539 ]

     ══ Failed tests ════════════════════════════════════════════════════════════════
     ── Failure (test_popkin.R:250:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(X)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:255:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(X + 0)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:260:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(2L - X)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:265:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(2 - X)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:271:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(X, m_chunk_max = 1)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:413:5): function returns precomputed values: popkin ──
     `obj <- popkin(X, want_M = TRUE)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:417:5): function returns precomputed values: popkin ──
     `obj <- popkin(X, subpops, want_M = TRUE)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:956:5): popkin_af works ──────────────────────────────
     `coancestry2 <- popkin_af(P)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:961:5): popkin_af works ──────────────────────────────
     `obj <- popkin_af(P, want_M = TRUE)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:968:5): popkin_af works ──────────────────────────────
     `coancestry2 <- popkin_af(P_miss)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:973:5): popkin_af works ──────────────────────────────
     `obj <- popkin_af(P_miss, want_M = TRUE)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:980:5): popkin_af works ──────────────────────────────
     `obj2 <- popkin_af(t(P_miss), want_M = TRUE, loci_on_cols = TRUE)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin_BEDMatrix.R:17:9): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(X)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin_fn.R:34:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(Xf, n = n)` produced warnings.

     [ FAIL 14 | WARN 26 | SKIP 0 | PASS 539 ]
     Error: Test failures
     Execution halted
Flavor: r-release-windows-x86_64