* using log directory 'd:/Rcompile/CRANpkg/local/4.3/popkin.Rcheck'
* using R Under development (unstable) (2022-08-11 r82713 ucrt)
* using platform: x86_64-w64-mingw32 (64-bit)
* using session charset: UTF-8
* checking for file 'popkin/DESCRIPTION' ... OK
* this is package 'popkin' version '1.3.17'
* package encoding: UTF-8
* checking package namespace information ... OK
* checking package dependencies ... OK
* checking if this is a source package ... OK
* checking if there is a namespace ... OK
* checking for hidden files and directories ... OK
* checking for portable file names ... OK
* checking whether package 'popkin' can be installed ... OK
* checking installed package size ... OK
* checking package directory ... OK
* checking 'build' directory ... OK
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* checking top-level files ... OK
* checking for left-over files ... OK
* checking index information ... OK
* checking package subdirectories ... OK
* checking R files for non-ASCII characters ... OK
* checking R files for syntax errors ... OK
* checking whether the package can be loaded ... OK
* checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK
* checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK
* checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK
* checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK
* checking loading without being on the library search path ... OK
* checking use of S3 registration ... OK
* checking dependencies in R code ... OK
* checking S3 generic/method consistency ... OK
* checking replacement functions ... OK
* checking foreign function calls ... OK
* checking R code for possible problems ... [7s] OK
* checking Rd files ... [1s] OK
* checking Rd metadata ... OK
* checking Rd cross-references ... OK
* checking for missing documentation entries ... OK
* checking for code/documentation mismatches ... OK
* checking Rd \usage sections ... OK
* checking Rd contents ... OK
* checking for unstated dependencies in examples ... OK
* checking line endings in C/C++/Fortran sources/headers ... OK
* checking pragmas in C/C++ headers and code ... OK
* checking compiled code ... OK
* checking installed files from 'inst/doc' ... OK
* checking files in 'vignettes' ... OK
* checking examples ... [4s] OK
* checking for unstated dependencies in 'tests' ... OK
* checking tests ... [11s] ERROR
  Running 'testthat.R' [11s]
Running the tests in 'tests/testthat.R' failed.
Complete output:
  > library(testthat)
  > library(popkin)
  > 
  > test_check('popkin')
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  OS - Alias wurde nicht gefunden.
  [ FAIL 14 | WARN 26 | SKIP 0 | PASS 539 ]
  
  ══ Failed tests ════════════════════════════════════════════════════════════════
  ── Failure (test_popkin.R:250:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
  `obj <- popkin_A(X)` produced warnings.
  ── Failure (test_popkin.R:255:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
  `obj <- popkin_A(X + 0)` produced warnings.
  ── Failure (test_popkin.R:260:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
  `obj <- popkin_A(2L - X)` produced warnings.
  ── Failure (test_popkin.R:265:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
  `obj <- popkin_A(2 - X)` produced warnings.
  ── Failure (test_popkin.R:271:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
  `obj <- popkin_A(X, m_chunk_max = 1)` produced warnings.
  ── Failure (test_popkin.R:413:5): function returns precomputed values: popkin ──
  `obj <- popkin(X, want_M = TRUE)` produced warnings.
  ── Failure (test_popkin.R:417:5): function returns precomputed values: popkin ──
  `obj <- popkin(X, subpops, want_M = TRUE)` produced warnings.
  ── Failure (test_popkin.R:956:5): popkin_af works ──────────────────────────────
  `coancestry2 <- popkin_af(P)` produced warnings.
  ── Failure (test_popkin.R:961:5): popkin_af works ──────────────────────────────
  `obj <- popkin_af(P, want_M = TRUE)` produced warnings.
  ── Failure (test_popkin.R:968:5): popkin_af works ──────────────────────────────
  `coancestry2 <- popkin_af(P_miss)` produced warnings.
  ── Failure (test_popkin.R:973:5): popkin_af works ──────────────────────────────
  `obj <- popkin_af(P_miss, want_M = TRUE)` produced warnings.
  ── Failure (test_popkin.R:980:5): popkin_af works ──────────────────────────────
  `obj2 <- popkin_af(t(P_miss), want_M = TRUE, loci_on_cols = TRUE)` produced warnings.
  ── Failure (test_popkin_BEDMatrix.R:17:9): function returns precomputed values: popkin_A ──
  `obj <- popkin_A(X)` produced warnings.
  ── Failure (test_popkin_fn.R:34:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
  `obj <- popkin_A(Xf, n = n)` produced warnings.
  
  [ FAIL 14 | WARN 26 | SKIP 0 | PASS 539 ]
  Error: Test failures
  Execution halted
* checking for unstated dependencies in vignettes ... OK
* checking package vignettes in 'inst/doc' ... OK
* checking re-building of vignette outputs ... [8s] OK
* checking PDF version of manual ... OK
* DONE
Status: 1 ERROR